虽然 MHTML 编码的文件包含纯 HTML 代码的部分，但尝试将 MHTML 转换为 HTML 时可能会出现复杂情况。一些程序能够读取 MHTML（或多用途互联网邮件扩展 (MIME) 超文本标记语言 (HTML)）文件和派生格式，但需要特殊类型的程序才能将文件内容转换并写入 HTML。可能会出现问题，因为来自网站的数字数据被编码在文件中，并且使用指向本地所有信息的正确链接重建网站可能是一项艰巨的任务。大多数操作系统都有允许将 MHTML 转换为 HTML 的程序，尽管用户可能需要进行额外的工作。
将文件从 MHTML 转换为 HTML 的主要问题是写入文件中的二进制数据。数据的保存方式允许 Web 浏览器读取和显示 MHTML 文件，但无法轻松转换同一文件。 MHTML 已存储作为一种嵌入式代码，它使用不同的变量来组织数字文件的位置。二进制信息（例如在线图像）存储在原始网站上，并带有指向在线位置的链接。此信息将被删除并转换为 MHTML 文件的局部变量，因此很难将二进制媒体实际匹配到 HTML 文档中的正确位置和格式。
HTML 代码可能难以转换为 MHTML，通常会导致错误。
很少有程序可以将 MHTML 转换为 HTML。有一些插件和其他附加组件可以允许程序加载、编辑文件，然后将文件重新保存回 MHTML，但只有少数独立程序会尝试将其转换为 HTML。通常，这些程序要求用户查看代码以理清二进制文件应放置在代码中的位置，从而允许他们从存档中重建页面。
并非所有网页都可以准确地保存为 MHTML 文件。可以作为媒体嵌入到网站上的各种复杂格式将无法正确保存（如果有的话）。这包括 Java® 小程序、流媒体和许多依赖于浏览计算机无法访问的服务器上其他文件的脚本。
将 MHTML 转换为 HTML 的最有效方法是找到独立的程序和插件将逐步将文件从一种格式转换为另一种格式，最后可能转换为 HTML。某些操作系统甚至在其自己的浏览器中不支持 MHTML 文件。如果一切都失败了，可以使用 Base 64 解码器手动解码文件中的二进制 MIME 信息，仅提取 HTML 并尝试手动重建存档中保存的网站，但此过程将非常耗时。堕胎密集。
